Em algumas aplicações, o ritmo de manipulação de DOM é tão intenso que se torna um problema de performance, situação que você pode presenciar facilmente ao manipular animações com SVG ou está mantendo uma conexão em tempo real ao servidor e precisa atualizar a interface do usuário correspondentemente. Nesses casos, das duas uma: Ou você gasta código pra caramba (mesmo usando uma biblioteca como o jQuery) manipulando cada elemento DOM individualmente, ou você apenas substitui todo o conteúdo do container dos elementos que você quer manipular. E aí reside um enorme problema de performance..